Международный центр по физике окружающей среды и экологии (МИЦ ФОСЭ) создан как обособленное структурное подразделение при Томском научном центре СО РАН в июне 1999 г. Научно-методическое руководство деятельностью МИЦ ФОСЭ ТНЦ СО РАН осуществляется Объединенным Ученым советом по физико-техническим наукам СО РАН. Возглавляет Центр член-корреспондент РАН В.В. Зуев.

Основными научными направлениями деятельности МИЦ ФОСЭ являются:

В рамках основного научного направления центр ведет работы по программе "Изучение техногенных и природных факторов в формировании экосистем в пойме реки Обь". Программа ведется в интересах сибирского региона и была поддержана двумя региональными грантами РФФИ "р98сибирь" (№98-05-03153, № 98-05-03154). В 1999 г. в рамках этой программы проведена комплексная экспедицию по реке Обь. Экспедиция в полном составе прошла по Оби от Томска до Сургута и отряд из 6 человек дошел до устья Иртыша. Общая протяженность маршрута составила 1600 км. В экспедиции приняли участие (финансовое и научное) 8 институтов Российской академии наук и Институт химии Макса Планка. Общая численность экспедиционного отряда составила 32 человека. Эта экспедиция проводилась в виде непрерывного трансекта. В 2000 году проводились стационарные комплексные исследования состояния окружающей среды, ориентированные на определение отдельных вкладов в состояние окружающей среды конкретных природно-территориальных комплексов от местных техногенных источников и привнесенных трансграничными атмосферными переносами из других регионов. В июле-августе2001г. при финансовой поддержке Минпромнауки Российской федерации и СО РАН была проведена вторая комплексная экологическая экспедиция "Пойма - 2001". Исследовались особенности химического состава и физических свойств атмосферы, речной воды, донных отложений и почвы в пойме р. Иртыш и влияние этих свойств на пойменные и водные экосистемы. Экспедиционный отряд состоял из исследователей из Томска, Москвы и Барнаула. На теплоходе было пройдено около 3750 км по маршруту Омск-Ханты - Мансийск - Омск. Во время 30 стоянок осуществлялся отбор проб для физико-химического и биологического анализа. Наряду с этим на локальном участке р. Иртыш (рейд г. Омска) были проведены лидарные измерения вертикального распределения аэрозоля и прозрачности атмосферы на разных длинах волн.

По проблемам основных исследований Центра организованы два совещания "Экология пойм сибирских рек и Арктики"( 1999, 2000гг.) и Международная конференция "Экология Сибири, Дальнего Востока и Арктики", которая состоялась 5-8 сентября 2001г. Конференции имела междисциплинарный характер, так как организаторам удалось консолидировать усилия ученых разных специальностей и управленцев. На конференции был рассмотрен широкий круг вопросов, связанных понятиями "окружающая среда" и "экология": изменения климата, физико-химическое состояние атмосферы и трансграничные переносы атмосферных загрязнений, биофизические, биохимические, биомедицинские и биологические методы тестирования экосистем, радиоактивное загрязнение, рациональное природопользование и многие другие. Участники конференции из российских регионов от Кольского полуострова до Камчатки, а также ближнего и дальнего зарубежья представили около 300 устных и стендовых докладов. Совещания и конференции были поддержаны грантами РФФИ (№00-05-74101, № 01-05-74056).

Центр привлекает к сотрудничеству научные учреждения и вузы г. Томска. Так, членами Научного совета МИЦФОСЭ являются представители ИОА СО РАН, ИОМ СО РАН, ИХН СО РАН, Томского государственного университета (ТГУ), в число организаторов научных мероприятий, проводимых центром, входят не только научные учреждения, но и ведущие томские вузы - ТГУ и Томский политехнический университет.

В рамках ФЦП "Государственная поддержка интеграции высшего образования и фундаментальной науки" на базе конференций в 2000-2001гг. проведены конкурсы молодых ученых, аспирантов и студентов, в которых приняли участие более 30 человек. Издательская деятельность МИЦФОСЭ заключается в издании программ, тезисов и трудов проводимых конференций.

В МИЦФОСЭ имеется Международный научный совет, утвержденный Президиумом СО РАН, в состав которого входят 12 представителей российских научных организаций и 5 зарубежных ученых, а также Администрации Томской области. Среди российских членов совета - 4 члена- корреспондента РАН и 7 докторов наук. Научный совет вырабатывает и анализирует основные направления научной деятельности Центра, формирует комплексные научные программы.